Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Itgb8Q0VBD0 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Itgb8Q0VBD0 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Itgb8Q0VBD0 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Itgb8Q0VBD0 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Itgb8Q0VBD0 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Itgb8Q0VBD0 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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Itgb8Q0VBD0 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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