Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Ttc21bQ0HA38 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Ttc21bQ0HA38 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Ttc21bQ0HA38 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Ttc21bQ0HA38 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Ttc21bQ0HA38 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Ttc21bQ0HA38 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Ttc21bQ0HA38 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Ttc21bQ0HA38 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Ttc21bQ0HA38 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc21bQ0HA38 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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