Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nf1Q04690 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms