Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
GscQ02591 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
GscQ02591 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
GscQ02591 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
GscQ02591 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms