Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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