Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.3 ms