Protein–RNA interactions for Protein: P58006

Sesn1, Sestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sesn1P58006 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sesn1P58006 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms