Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Usp25P57080 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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