Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms