Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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