Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms