Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms