Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms