Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ThpoP40226 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
ThpoP40226 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ThpoP40226 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ThpoP40226 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms