Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TtlP38585 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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TtlP38585 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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TtlP38585 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TtlP38585 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtlP38585 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms