Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PpargP37238 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PpargP37238 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PpargP37238 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PpargP37238 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PpargP37238 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PpargP37238 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PpargP37238 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PpargP37238 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PpargP37238 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PpargP37238 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PpargP37238 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PpargP37238 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PpargP37238 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PpargP37238 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PpargP37238 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PpargP37238 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PpargP37238 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PpargP37238 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PpargP37238 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PpargP37238 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PpargP37238 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms