Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprmP28828 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm18391-201ENSMUST00000217189 658 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprmP28828 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gal-201ENSMUST00000025842 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprmP28828 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm7815-201ENSMUST00000196104 832 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm18124-201ENSMUST00000210695 706 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprmP28828 AY761184-201ENSMUST00000071886 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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