Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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PdgfraP26618 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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PdgfraP26618 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
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