Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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