Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnnc1P19123 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms