Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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H2-Eb1P04230 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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H2-Eb1P04230 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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H2-Eb1P04230 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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H2-Eb1P04230 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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H2-Eb1P04230 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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H2-Eb1P04230 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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