Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DffaO54786 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DffaO54786 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DffaO54786 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DffaO54786 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DffaO54786 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DffaO54786 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DffaO54786 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DffaO54786 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DffaO54786 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DffaO54786 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DffaO54786 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
DffaO54786 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DffaO54786 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
DffaO54786 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DffaO54786 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DffaO54786 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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DffaO54786 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
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DffaO54786 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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DffaO54786 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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DffaO54786 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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DffaO54786 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DffaO54786 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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DffaO54786 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DffaO54786 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DffaO54786 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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DffaO54786 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DffaO54786 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DffaO54786 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DffaO54786 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DffaO54786 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DffaO54786 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DffaO54786 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DffaO54786 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DffaO54786 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DffaO54786 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DffaO54786 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DffaO54786 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms