Protein–RNA interactions for Protein: O35137

Alx4, Homeobox protein aristaless-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx4O35137 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Alx4O35137 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Alx4O35137 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Alx4O35137 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Alx4O35137 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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