Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Dcun1d4-201ENSMUST00000063882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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