Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Nccrp1G3X9C2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Nccrp1G3X9C2 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Nccrp1G3X9C2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nccrp1G3X9C2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Nccrp1G3X9C2 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Nccrp1G3X9C2 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Nccrp1G3X9C2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Nccrp1G3X9C2 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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