Protein–RNA interactions for Protein: D3Z257

Gm5930, Predicted gene 5930, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5930D3Z257 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5930D3Z257 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms