Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms