Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf217D3YYI7 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms