Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11cB4XVP9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms