Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clrn2B2RVW2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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