Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc163A2AGD7 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms