Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3238W4VSP7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3238W4VSP7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3238W4VSP7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3238W4VSP7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3238W4VSP7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3238W4VSP7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3238W4VSP7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3238W4VSP7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3238W4VSP7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3238W4VSP7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3238W4VSP7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3238W4VSP7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3238W4VSP7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3238W4VSP7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3238W4VSP7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3238W4VSP7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3238W4VSP7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3238W4VSP7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3238W4VSP7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3238W4VSP7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3238W4VSP7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3238W4VSP7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3238W4VSP7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3238W4VSP7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3238W4VSP7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3238W4VSP7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3238W4VSP7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3238W4VSP7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3238W4VSP7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3238W4VSP7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3238W4VSP7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3238W4VSP7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3238W4VSP7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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