Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vstm4T1NXB5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vstm4T1NXB5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms