Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tulp1Q9Z273 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tulp1Q9Z273 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tulp1Q9Z273 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms