Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stxbp4Q9WV89 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stxbp4Q9WV89 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms