Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUF2

Egr4, Early growth response protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr4Q9WUF2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Egr4Q9WUF2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Egr4Q9WUF2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms