Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PplQ9R269 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PplQ9R269 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PplQ9R269 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PplQ9R269 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PplQ9R269 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PplQ9R269 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PplQ9R269 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
PplQ9R269 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PplQ9R269 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PplQ9R269 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PplQ9R269 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PplQ9R269 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PplQ9R269 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PplQ9R269 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PplQ9R269 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PplQ9R269 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PplQ9R269 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PplQ9R269 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PplQ9R269 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PplQ9R269 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PplQ9R269 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PplQ9R269 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PplQ9R269 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PplQ9R269 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PplQ9R269 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PplQ9R269 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PplQ9R269 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PplQ9R269 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PplQ9R269 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PplQ9R269 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PplQ9R269 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PplQ9R269 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PplQ9R269 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PplQ9R269 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PplQ9R269 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PplQ9R269 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PplQ9R269 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PplQ9R269 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PplQ9R269 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PplQ9R269 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PplQ9R269 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PplQ9R269 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PplQ9R269 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PplQ9R269 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PplQ9R269 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PplQ9R269 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PplQ9R269 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PplQ9R269 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PplQ9R269 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PplQ9R269 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PplQ9R269 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PplQ9R269 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PplQ9R269 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PplQ9R269 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PplQ9R269 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PplQ9R269 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PplQ9R269 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PplQ9R269 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PplQ9R269 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PplQ9R269 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PplQ9R269 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PplQ9R269 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PplQ9R269 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PplQ9R269 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PplQ9R269 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PplQ9R269 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PplQ9R269 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PplQ9R269 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PplQ9R269 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PplQ9R269 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PplQ9R269 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PplQ9R269 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PplQ9R269 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PplQ9R269 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PplQ9R269 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PplQ9R269 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PplQ9R269 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PplQ9R269 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PplQ9R269 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PplQ9R269 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PplQ9R269 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PplQ9R269 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PplQ9R269 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PplQ9R269 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PplQ9R269 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PplQ9R269 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PplQ9R269 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PplQ9R269 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PplQ9R269 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PplQ9R269 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PplQ9R269 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PplQ9R269 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PplQ9R269 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PplQ9R269 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PplQ9R269 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PplQ9R269 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PplQ9R269 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PplQ9R269 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PplQ9R269 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms