Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Abcc6Q9R1S7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Abcc6Q9R1S7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Abcc6Q9R1S7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Abcc6Q9R1S7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Abcc6Q9R1S7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Abcc6Q9R1S7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Abcc6Q9R1S7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Abcc6Q9R1S7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Abcc6Q9R1S7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Abcc6Q9R1S7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Abcc6Q9R1S7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Abcc6Q9R1S7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Abcc6Q9R1S7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Abcc6Q9R1S7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Abcc6Q9R1S7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Abcc6Q9R1S7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Abcc6Q9R1S7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Abcc6Q9R1S7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Abcc6Q9R1S7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Abcc6Q9R1S7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Abcc6Q9R1S7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Abcc6Q9R1S7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Abcc6Q9R1S7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Abcc6Q9R1S7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Abcc6Q9R1S7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Abcc6Q9R1S7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Abcc6Q9R1S7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Abcc6Q9R1S7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Abcc6Q9R1S7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Abcc6Q9R1S7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Abcc6Q9R1S7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
Abcc6Q9R1S7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Abcc6Q9R1S7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Abcc6Q9R1S7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Abcc6Q9R1S7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Abcc6Q9R1S7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Abcc6Q9R1S7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Abcc6Q9R1S7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Abcc6Q9R1S7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Abcc6Q9R1S7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Abcc6Q9R1S7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Abcc6Q9R1S7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Abcc6Q9R1S7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Abcc6Q9R1S7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Abcc6Q9R1S7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Abcc6Q9R1S7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abcc6Q9R1S7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abcc6Q9R1S7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abcc6Q9R1S7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Abcc6Q9R1S7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abcc6Q9R1S7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abcc6Q9R1S7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abcc6Q9R1S7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abcc6Q9R1S7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Abcc6Q9R1S7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abcc6Q9R1S7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abcc6Q9R1S7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Abcc6Q9R1S7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Abcc6Q9R1S7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Abcc6Q9R1S7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Abcc6Q9R1S7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Abcc6Q9R1S7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abcc6Q9R1S7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms