Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fhl3Q9R059 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fhl3Q9R059 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms