Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnnt3Q9QZ47 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnnt3Q9QZ47 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms