Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrac1Q9JKP8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrac1Q9JKP8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms