Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIK5

Ddx21, Nucleolar RNA helicase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx21Q9JIK5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx21Q9JIK5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx21Q9JIK5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx21Q9JIK5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms