Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9D9S1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9D9S1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9S1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9D9S1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9S1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9D9S1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D9S1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9D9S1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms