Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnot8Q9D8X5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cnot8Q9D8X5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms