Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tvp23bQ9D8T4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tvp23bQ9D8T4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms