Protein–RNA interactions for Protein: Q9D844

Dnajc4, DnaJ homolog subfamily C member 4, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc4Q9D844 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnajc4Q9D844 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajc4Q9D844 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms