Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chmp5Q9D7S9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chmp5Q9D7S9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chmp5Q9D7S9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms