Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc94Q9D6J3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc94Q9D6J3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc94Q9D6J3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms