Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clvs1Q9D4C9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Clvs1Q9D4C9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clvs1Q9D4C9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms