Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Snapc3Q9D2C9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snapc3Q9D2C9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snapc3Q9D2C9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snapc3Q9D2C9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snapc3Q9D2C9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snapc3Q9D2C9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Snapc3Q9D2C9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Snapc3Q9D2C9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snapc3Q9D2C9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snapc3Q9D2C9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Snapc3Q9D2C9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Snapc3Q9D2C9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snapc3Q9D2C9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snapc3Q9D2C9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Snapc3Q9D2C9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snapc3Q9D2C9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snapc3Q9D2C9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snapc3Q9D2C9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Snapc3Q9D2C9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snapc3Q9D2C9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snapc3Q9D2C9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snapc3Q9D2C9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snapc3Q9D2C9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snapc3Q9D2C9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Snapc3Q9D2C9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snapc3Q9D2C9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Snapc3Q9D2C9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snapc3Q9D2C9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snapc3Q9D2C9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snapc3Q9D2C9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Snapc3Q9D2C9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snapc3Q9D2C9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Snapc3Q9D2C9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Snapc3Q9D2C9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Snapc3Q9D2C9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Snapc3Q9D2C9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snapc3Q9D2C9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snapc3Q9D2C9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snapc3Q9D2C9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snapc3Q9D2C9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snapc3Q9D2C9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snapc3Q9D2C9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snapc3Q9D2C9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snapc3Q9D2C9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snapc3Q9D2C9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snapc3Q9D2C9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snapc3Q9D2C9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snapc3Q9D2C9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snapc3Q9D2C9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snapc3Q9D2C9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snapc3Q9D2C9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snapc3Q9D2C9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snapc3Q9D2C9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snapc3Q9D2C9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snapc3Q9D2C9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms